将蛋糕放凉后再装饰，以免糖霜和装饰材料变粘。大概要30分钟。不管蛋糕上有没有糖霜，先用锡纸、保鲜膜或蜡纸把蛋糕松松的覆盖起来。涂有奶油糖霜的纸杯蛋糕在室温下可以保存2天。涂有奶油芝士或打发奶油的纸杯蛋糕，应冷藏。吃的那天，只在蛋糕上涂一层软糖。

为了长期储存蛋糕，可以提前烤制好蛋糕，冷却至准备好涂上糖霜并开始食用时(涂上糖霜的蛋糕不适合冷冻，因为冰冻会改变糖霜的质地)。这里有一些冷冻纸杯蛋糕的建议：把冷却蛋糕放入密封的塑料容器或可重复密封的保鲜袋内，不要叠放。不涂糖霜的蛋糕可以在3个月内冷冻。在冰箱冷藏或室温下，让蛋糕解冻都是可以的。融化前，打开或除去包装。冰冻蛋糕时，可以涂上糖霜，这样更容易涂上，因为蛋糕表面是坚硬的。最好的办法就是不要冷冻那些带着装饰糖，硬糖和彩糖的纸杯蛋糕，因为它们解冻时会掉颜色。